Forschungsgruppe Bioinformatik
In der Bioinformatikgruppe arbeiten wir an zwei Themen: Computer-Genomik und Speziation. In der ComputerGenomik verwenden wir moderne Algorithmen, die auf Suffixbäumen basieren, um nah verwandte Genome zu vergleichen. Unser Ansatz kommt ohne Alignment aus, was ihn schnell und Speicher-effizient macht. Eines der Ziele dieser Arbeit ist, Stammbäume aus nicht-alignierten Genomen zu berechnen.
Auf dem Gebiet der Speziation arbeiten wir mit den Experimentalisten in der Abteilung "Evolutionäre Genetik" zusammen. Zum Beispiel erforschen wir im Augenblick mit Hilfe schneller Sequenziermethoden das Transkriptom von Krähen.
Mehr Informationen hier: guanine.evolbio.mpg.de
