Publikationen von Kristian K. Ullrich

Zeitschriftenartikel (49)

1.
Zeitschriftenartikel
Trinh, J.; Schaake, S.; Gabbert, C.; Lüth, T.; Cowley, S. A.; Fienemann, A.; Ullrich, K. K.; Klein, C.; Seibler, P.: Optical genome mapping of structural variants in Parkinson’s disease-related induced pluripotent stem cells. BMC Genomics 25, 980 (2024)
2.
Zeitschriftenartikel
Chandler, J. O.; Wilhelmsson, P. K.I.; Fernandez-Pozo, N.; Graeber, K.; Arshad, W.; Pérez, M.; Steinbrecher, T.; Ullrich, K. K.; Nguyen, T.-P.; Mérai, Z. et al.; Mummenhoff, K.; Theißen, G.; Strnad, M.; Scheid, O. M.; Schranz, M. E.; Petřík, I.; Tarkowská, D.; Novák, O.; Rensing, S. A.; Leubner-Metzger, G.: The dimorphic diaspore model Aethionema arabicum (Brassicaceae): Distinct molecular and morphological control of responses to parental and germination temperatures. The Plant Cell 00 (00), koae085 (2024)
3.
Zeitschriftenartikel
Abualia, K.; Damm, E.; Ullrich, K. K.; Mukaj, A.; Parvanov, E.; Forejt, J.; Odenthal-Hesse, L.: Natural variation in the zinc-finger-encoding exon of Prdm9 affects hybrid sterility phenotypes in mice. Genetics 226 (3), iyae004 (2024)
4.
Zeitschriftenartikel
Murik, O.; Geffen, O.; Shotland, Y.; Fernandez-Pozo, N.; Ullrich, K. K.; Walther, D.; Rensing, S. A.; Treves, H.: Genomic imprints of unparalleled growth. New Phytologist 241 (3), S. 1144 - 1160 (2024)
5.
Zeitschriftenartikel
Delmore, K.; Doren, B. M. V.; Ullrich, K.; Curk, T.; van der Jeugd, H. P.; Liedvogel, M.: Structural genomic variation and migratory behavior in a wild songbird. Evolution Letters 7 (6), S. 401 - 412 (2023)
6.
Zeitschriftenartikel
Hu, R.; Li, X.; Hu, Y.; Zhang, R.; Lv, Q.; Zhang, M.; Sheng, X.; Zhao, F.; Chen, Z.; Ding, Y. et al.; Yuan, H.; Wu, X.; Xing, S.; Yan, X.; Bao, F.; Wan, P.; Xiao, L.; Wang, X.; Xiao, W.; Decker, E. L.; van Gessel, N.; Renault, H.; Wiedemann, G.; Horst, N. A.; Haas, F. B.; Wilhelmsson, P. K.I.; Ullrich, K. K.; Neumann, E.; Lv, B.; Liang, C.; Du, H.; Lu, H.; Gao, Q.; Cheng, Z.; You, H.; Xin, P.; Chu, J.; Huang, C.-H.; Liu, Y.; Dong, S.; Zhang, L.; Chen, F.; Deng, L.; Duan, F.; Zhao, W.; Li, K.; Li, Z.; Li, X.; Cui, H.; Zhang, Y. E.; Ma, C.; Zhu, R.; Jia, Y.; Wang, M.; Hasebe, M.; Fu, J.; Goffinet, B.; Ma, H.; Rensing, S. A.; Reski, R.; He, Y.: Adaptive evolution of the enigmatic Takakia now facing climate change in Tibet. Cell 186 (17), S. 3558 - 3576.e17 (2023)
7.
Zeitschriftenartikel
Živanović, B. D.; Ullrich, K.; Spasić, S. Z.; Galland, P.: Auxin- and pH-induced guttation in Phycomyces sporangiophores: relation between guttation and diminished elongation growth. Protoplasma 260, S. 1109 - 1133 (2023)
8.
Zeitschriftenartikel
Almeida-Silva, F.; Zhao, T.; Ullrich, K. K.; Schranz, M. E.; Van de Peer, Y.: syntenet: an R/Bioconductor package for the inference and analysis of synteny networks. Bioinformatics 39 (1), btac806 (2023)
9.
Zeitschriftenartikel
Ullrich, K. K.; Glynatsi, N. E.: oggmap: a Python package to extract gene ages per orthogroup and link them with single-cell RNA data. Bioinformatics 39 (11), btad657 (2023)
10.
Zeitschriftenartikel
Damm, E.; Ullrich, K. K.; Amos, W. B.; Odenthal-Hesse, L.: Evolution of the recombination regulator PRDM9 in minke whales. BMC Genomics 23, 212 (2022)
11.
Zeitschriftenartikel
Strelin, M. M.; Zattara, E. E.; Ullrich, K.; Schallenberg-Rüdinger, M.; Rensing, S.: Delayed differentiation of epidermal cells walls can underlie pedomorphosis in plants: the case of pedomorphic petals in the hummingbird-pollinated Caiophora hibiscifolia (Loasaceae, subfam. Loasoideae) species. EvoDevo 13, 1 (2022)
12.
Zeitschriftenartikel
Genau, A. C.; Li, Z.; Renzaglia, K. S.; Fernandez Pozo, N.; Nogué, F.; Haas, F. B.; Wilhelmsson, P. K. I.; Ullrich, K. K.; Schreiber, M.; Meyberg, R. et al.; Grosche, C.; Rensing, S. A.: HAG1 and SWI3A/B control of male germ line development in P. patens suggests conservation of epigenetic reproductive control across land plants. Plant Reproduction 34 (2), S. 149 - 173 (2021)
13.
Zeitschriftenartikel
Almalki, F.; Nonnecke, E. B.; Castillo, P. A.; Bevin-Holder, A.; Ullrich, K. K.; Lönnerdal, B.; Odenthal-Hesse, L.; Bevins, C. L.; Hollox, E. J.: Extensive variation in the intelectin gene family in laboratory and wild mouse strains. Scientific Reports 11, 15548 (2021)
14.
Zeitschriftenartikel
Zhang, W.; Xie, C.; Ullrich, K.; Zhang, Y. E.; Tautz, D.: The mutational load in natural populations is significantly affected by high primary rates of retroposition. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 118 (6), e2013043118 (2021)
15.
Zeitschriftenartikel
Ullrich, K. K.: CRBHits: From Conditional Reciprocal Best Hits toCodon Alignments and Ka/Ks in R. The Journal of Open Source Software 5 (55), 2424 (2020)
16.
Zeitschriftenartikel
Xie, C.; Bekpen, C.; Künzel, S.; Keshavarz, M.; Krebs-Wheaton, R.; Skrabar, N.; Ullrich, K. K.; Zhang, W.; Tautz, D.: Dedicated transcriptomics combined with power analysis lead to functional understanding of genes with weak phenotypic changes in knockout lines. PLoS Computational Biology 16 (11), e1008354 (2020)
17.
Zeitschriftenartikel
Fernandez-Pozo, N.; Haas, F. B.; Meyberg, R.; Ullrich, K. K.; Hiss, M.; Perroud, P.-F.; Hanke, S.; Kratz, V.; Powell, A. F.; Vesty, E. F. et al.; Daum, C. G.; Zane, M.; Lipzen, A.; Sreedasyam, A.; Grimwood, J.; Coates, J. C.; Barry, K.; Schmutz, J.; Mueller, L. A.; Rensing, S. A.: PEATmoss (Physcomitrella Expression Atlas Tool): a unified gene expression atlas for the model plant Physcomitrella patens. The Plant Journal 102 (1), S. 165 - 177 (2020)
18.
Zeitschriftenartikel
Linnenbrink, M.; Ullrich, K. K.; McConnell, E.; Tautz, D.: The amylase gene cluster in house mice (Mus musculus) was subject to repeated introgression including the rescue of a pseudogene. BMC Evolutionary Biology 20, 56 (2020)
19.
Zeitschriftenartikel
Carpenter, E. J.; Matasci, N.; Ayyampalayam, S.; Wu, S.; Sun, J.; Yu, J.; Jimenez Vieira, F. R.; Bowler, C.; Dorrell, R. G.; Gitzendanner, M. A. et al.; Li, L.; Du, W.; Ullrich, K. K.; Wickett, N. J.; Barkmann, T. J.; Barker, M. S.; Leebens-Mack, J. H.; Wong, G. K.-S.: Access to RNA-sequencing data from 1,173 plant species: The 1000 Plant transcriptomes initiative (1KP). GigaScience 8 (10), giz126 (2019)
20.
Zeitschriftenartikel
Leebens-Mack, J. H.; Barker, M. S.; Carpenter, E. J.; Deyholos, M. K.; Gitzendanner, M. A.; Graham, S. W.; Grosse, I.; Li, Z.; Melkonian, M.; Mirarab, S. et al.; Porsch, M.; Quint, M.; Rensing, S. A.; Soltis, D. E.; Soltis, P. S.; Stevenson, D. W.; Ullrich, K. K.; Wickett, N. J.; DeGironimo, L.; Edger, P. P.; Jordon-Thaden, I. E.; Joya, S.; Liu, T.; Melkonian, B.; Miles, N. W.; Pokorny, L.; Quigley, C.; Thomas, P.; Villarreal, J. C.; Augustin, M. M.; Barrett, M. D.; Baucom, R. S.; Beerling, D. J.; Benstein, R. M.; Biffin, E.; Brockington, S. F.; Burge, D. O.; Burris, J. N.; Burris, K. P.; Burtet-Sarramegna, V.; Caicedo, A. L.; Cannon, S. B.; Çebi, Z.; Chang, Y.; Chater, C.; Cheeseman, J. M.; Chen, T.; Clarke, N. D.; Clayton, H.; Covshoff, S.; Crandall-Stotler, B. J.; Cross, H.; dePamphilis, C. W.; Der, J. P.; Determann, R.; Dickson, R. C.; Di Stilio, V. S.; Ellis, S.; Fast, E.; Feja, N.; Field, K. J.; Filatov, D. A.; Finnegan, P. M.; Floyd, S. K.; Fogliani, B.; García, N.; Gâteblé, G.; Godden, G. T.; Goh, F.; Greiner, S.; Harkess, A.; Heaney, J. M.; Helliwell, K. E.; Heyduk, K.; Hibberd, J. M.; Hodel, R. G. J.; Hollingsworth, P. M.; Johnson, M. T. J.; Jost, R.; Joyce, B.; Kapralov, M. V.; Kazamia, E.; Kellogg, E. A.; Koch, M. A.; Von Konrat, M.; Könyves, K.; Kutchan, T. M.; Lam, V.; Larsson, A.; Leitch, A. R.; Lentz, R.; Li, F.-W.; Lowe, A. J.; Ludwig, M.; Manos, P. S.; Mavrodiev, E.; McCormick, M. K.; McKain, M.; McLellan, T.; McNeal, J. R.; Miller, R. E.; Nelson, M. N.; Peng, Y.; Ralph, P.; Real, D.; Riggins, C. W.; Ruhsam, M.; Sage, R. F.; Sakai, A. K.; Scascitella, M.; Schilling, E. E.; Schlösser, E.-M.; Sederoff, H.; Servick, S.; Sessa, E. B.; Shaw, A. J.; Shaw, S. W.; Sigel, E. M.; Skema, C.; Smith, A. G.; Smithson, A.; Stewart, C. N.; Stinchcombe, J. R.; Szövényi, P.; Tate, J. A.; Tiebel, H.; Trapnell, D.; Villegente, M.; Wang, C.-N.; Weller, S. G.; Wenzel, M.; Weststrand, S.; Westwood, J. H.; Whigham, D. F.; Wu, S.; Wulff, A. S.; Yang, Y.; Zhu, D.; Zhuang, C.; Zuidof, J.; Chase, M. W.; Pires, J. C.; Rothfels, C. J.; Yu, J.; Chen, C.; Chen, L.; Cheng, S.; Li, J.; Li, R.; Li, X.; Lu, H.; Ou, Y.; Sun, X.; Tan, X.; Tang, J.; Tian, Z.; Wang, F.; Wang, J.; Wei, X.; Xu, X.; Yan, Z.; Yang, F.; Zhong, X.; Zhou, F.; Zhu, Y.; Zhang, Y.; Ayyampalayam, S.; Barkman, T. J.; Nguyen, N.-p.; Matasci, N.; Nelson, D. R.; Sayyari, E.; Wafula, E. K.; Walls, R. L.; Warnow, T.; An, H.; Arrigo, N.; Baniaga, A. E.; Galuska, S.; Jorgensen, S. A.; Kidder, T. I.; Kong, H.; Lu-Irving, P.; Marx, H. E.; Qi, X.; Reardon, C. R.; Sutherland, B. L.; Tiley, G. P.; Welles, S. R.; Yu, R.; Zhan, S.; Gramzow, L.; Theißen, G.; Wong, G. K.-S.; One Thousand Plant Transcriptomes Initiative: One thousand plant transcriptomes and the phylogenomics of green plants. Nature 574 (7780), S. 679 - 685 (2019)
Zur Redakteursansicht