Publikationen von Kristian Karsten Ullrich

Xie, C.; Bekpen, C.; Künzel, S.; Keshavarz, M.; Krebs-Wheaton, R.; Skrabar, N.; Ullrich, K. K.; Tautz, D.: A de novo evolved gene in the house mouse regulates female pregnancy cycles. eLife 8, e44392 (2019)

Mosca, E.; Cruz, F.; Gómez-Garrido, J.; Bianco, L.; Rellstab, C.; Brodbeck, S.; Csilléry, K.; Fady, B.; Fladung, M.; Fussi, B. et al.; Gömöry, D.; González-Martínez, S. C.; Grivet, D.; Gut, M.; Hansen, O. K.; Heer, K.; Kaya, Z.; Krutovsky, K. V.; Kersten, B.; Liepelt, S.; Opgenoorth, L.; Sperisen, C.; Ullrich, K. K.; Vendramin, G. G.; Westergren, M.; Ziegenhagen, B.; Alioto, T.; Gugerli, F.; Heinze, B.; Höhn, M.; Troggio, M.; Neale, D. B.: A reference genome sequence for the european Silver Fir (Abies alba Mill.): a ommunity-generated genomic resource. G3: Genes, Genomes, Genetics 9 (7), S. 2039 - 2049 (2019)

Scheid, O. M.; Mérai, Z.; Graeber, K.; Arshad, W.; Leubner-Metzger, G.; Grosche, C.; Ullrich, K. K.; Wilhelmsson, P.; Rensing, S. A.; Tarkowská, D. et al.; Strnad, M.; Turečková, V.: Aethionema arabicum: a novel model plant to study the light control of seed germination. Journal of Experimental Botany 70 (12), S. 3313 - 3328 (2019)

Wilhelmsson, P. K. I.; Chandler, J. O.; Fernandez-Pozo, N.; Graeber, K.; Ullrich, K. K.; Arshad, W.; Khan, S.; Hofberger, J. A.; Buchta, K.; Edger, P. P. et al.; Pires, J. C.; Schranz, M. E.; Leubner-Metzger, G.; Rensing, S. A.: Usability of reference-free transcriptome assemblies for detection of differential expression: a case study on Aethionema arabicum dimorphic seeds. BMC Genomics 20, 95 (2019)

Heer, K.; Ullrich, K. K.; Hiss, M.; Liepelt, S.; Schulze Brüning, R.; Zhou, J.; Opgenoorth, L.; Rensing, S. A.: Detection of somatic epigenetic variation in Norway spruce via targeted bisulfite sequencing. Ecology and Evolution 8 (19), S. 9672 - 9682 (2018)

Živanović, B. D.; Ullrich, K. K.; Steffens, B.; Spasić, S. Z.; Galland, P.: The effect of auxin (indole-3-acetic acid) on the growth rate and tropism of the sporangiophore of Phycomyces blakesleeanus and identification of auxin-related genes. Protoplasma 255 (5), S. 1331 - 1347 (2018)

Nishiyama, T.; Sakayama, H.; de Vries, J.; Buschmann, H.; Saint-Marcoux, D.; Ullrich, K. K.; Haas, F. B.; Vanderstraeten, L.; Becker, D.; Lang, D. et al.; Vosolsobě, S.; Rombauts, S.; Wilhelmsson, P. K.I.; Janitza, P.; Kern, R.; Heyl, A.; Rümpler, F.; Villalobos, L. I. A. C.; Clay, J. M.; Skokan, R.; Toyoda, A.; Suzuki, Y.; Kagoshima, H.; Schijlen, E.; Tajeshwar, N.; Catarino, B.; Hetherington, A. J.; Saltykova, A.; Bonnot, C.; Breuninger, H.; Symeonidi, A.; Radhakrishnan, G. V.; Nieuwerburgh, F. V.; Deforce, D.; Chang, C.; Karol, K. G.; Hedrich, R.; Ulvskov, P.; Glöckner, G.; Delwiche, C. F.; Petrášek, J.; de Peer, Y. V.; Friml, J.; Beilby, M.; Dolan, L.; Kohara, Y.; Sugano, S.; Fujiyama, A.; Delaux, P.-M.; Quint, M.; Theißen, G.; Hagemann, M.; Harholt, J.; Dunand, C.; Zachgo, S.; Langdale, J.; Maumus, F.; Straeten, D. V. D.; Gould, S. B.; Rensing, S. A.: The Chara Genome: secondary complexity and implications for plant terrestrialization. Cell 174 (2), S. 448 - 468 (2018)

Lang, D.; Ullrich, K. K.; Murat, F.; Fuchs, J.; Jenkins, J.; Haas, F. B.; Piednoel, M.; Gundlach, H.; Bel, M. V.; Meyberg, R. et al.; Vives, C.; Morata, J.; Symeonidi, A.; Hiss, M.; Muchero, W.; Kamisugi, Y.; Saleh, O.; Blanc, G.; Decker, E. L.; van Gessel, N.; Grimwood, J.; Hayes, R. D.; Graham, S. W.; Gunter, L. E.; McDaniel, S. F.; Hoernstein, S. N.W.; Larsson, A.; Li, F.-W.; Perroud, P.-F.; Phillips, J.; Ranjan, P.; Rokshar, D. S.; Rothfels, C. J.; Schneider, L.; Shu, S.; Stevenson, D. W.; Thümmler, F.; Tillich, M.; Aguilar, J. C. V.; Widiez, T.; Wong, G. K.-S.; Wymore, A.; Zhang, Y.; Zimmer, A. D.; Quatrano, R. S.; Mayer, K. F.X.; Goodstein, D.; Casacuberta, J. M.; Vandepoele, K.; Reski, R.; Cuming, A. C.; Tuskan, G. A.; Maumus, F.; Salse, J.; Schmutz, J.; Rensing, S. A.: The Physcomitrella patens chromosome-scale assembly reveals moss genome structure and evolution. The Plant Journal 93 (3), S. 515 - 533 (2018)

Perroud, P.-F.; Haas, F. B.; Hiss, M.; Ullrich, K. K.; Alboresi, A.; Amirebrahimi, M.; Barry, K.; Bassi, R.; Bonhomme, S.; Chen, H. et al.; Coates, J. C.; Fujita, T.; Guyon-Debast, A.; Lang, D.; Lin, J.; Lipzen, A.; Nogué, F.; Oliver, M. J.; de Léon, I. P.; Quatrano, R. S.; Rameau, C.; Reiss, B.; Reski, R.; Ricca, M.; Saidi, Y.; Sun, N.; Szövenyi, P.; Sreedasyam, A.; Grimwood, J.; Stacey, G.; Schmutz, J.; Rensing, a. S. A.: The Physcomitrella patens gene atlas project: large-scale RNA-seq based expression data. The Plant Journal 95 (1), S. 168 - 182 (2018)

Schmitz, J. F.; Ullrich, K. K.; Bornberg-Bauer, E.: Incipient de novo genes can evolve from frozen accidents that escaped rapid transcript turnover. Nature Ecology & Evolution 2 (10), S. 1626 - 1632 (2018)

Weston, D. J.; Turetsky, M. R.; Johnson, M. G.; Granath, G.; Lindo, Z.; Belyea, L. R.; Rice, S. K.; Hanson, D. T.; Engelhardt, K. A. M.; Schmutz, J. et al.; Dorrepaal, E.; Euskirchen, E. S.; Stenøien, H. K.; Szövényi, P.; Jackson, M.; Piatkowski, B. T.; Muchero, W.; Norby, R. J.; Kostka, J. E.; Glass, J. B.; Rydin, H.; Limpens, J.; Tuittila, E.-S.; Ullrich, K. K.; Carrell, A.; Benscoter, B. W.; Chen, J.-G.; Oke, T. A.; Nilsson, M. B.; Ranjan, P.; Jacobson, D.; Lilleskov, E. A.; Clymo, R. S.; Shaw, A. J.: The Sphagnome Project: enabling ecological and evolutionary insights through a genus-level sequencing project. New Phytologist 217 (1), S. 16 - 25 (2018)

Richards, C. L.; Alonso, C.; Becker, C.; Bossdorf, O.; Bucher, E.; Colomé-Tatché, M.; Durka, W.; Engelhardt, J.; Gaspar, B.; Gogol-Döring, A. et al.; Grosse, I.; van Gurp, T. P.; Heer, K.; Kronholm, I.; Lampei, C.; Latzel, V.; Mirouze, M.; Opgenoorth, L.; Paun, O.; Prohaska, S. J.; Rensing, S. A.; Stadler, P. F.; Trucchi, E.; Ullrich, K.; Verhoeven, K. J. F.: Ecological plant epigenetics: Evidence from model and non-model species, and the way forward. Ecology Letters 20 (12), S. 1576 - 1590 (2017)

Wilhelmsson, P. K. I.; Mühlich, C.; Ullrich, K. K.; Rensing, S. A.: Comprehensive genome-wide classification reveals that many plant-specific transcription factors evolved in streptophyte algae. Genome Biology and Evolution 9 (12), S. 3384 - 3397 (2017)

Szövényi, P.; Ullrich, K. K.; Rensing, S. A.; Lang, D.; van Gessel, N.; Stenøien, H. K.; Conti, E.; Reski, R.: Selfing in haploid plants and efficacy of selection: codon usage bias in the model moss Physcomitrella patens. Genome Biology and Evolution 9 (1), S. 1528 - 1546 (2017)

Hiss, M.; Meyberg, R.; Westermann, J.; Haas, F. B.; Schneider, L.; Schallenberg-Reudinger, M.; Ullrich, K. K.; Rensing, S. A.: Sexual reproduction, sporophyte development and molecularvariation in the model moss Physcomitrella patens: introducing the ecotype Reute. The Plant Journal 90 (3), S. 606 - 620 (2017)

Dahlke, R. I.; Fraas, S.; Ullrich, K. K.; Heinemann, K.; Romeiks, M.; Rickmeyer, T.; Klebe, G.; Palme, K.; Lüthen, H.; Steffens, B.: Protoplast swelling and hypocotyl growth depend on different auxin signaling pathways. Plant Physiology 175 (2), S. 982 - 994 (2017)

Hiss, M.; Schneider, L.; Grosche, C.; Barth, M. A.; Neu, C.; Symeonidi, A.; Ullrich, K. K.; Perroud, P.-F.; Schallenberg-Rüdinger, M.; Rensing, S. A.: Combination of the endogenous lhcsr1 promoter and codon usage optimization boosts protein expression in the Moss Physcomitrella patens. Frontiers in Plant Science 8, 1842 (2017)

Roschanski, A. M.; Csillery, K.; Liepelt, S.; Oddou-Muratorio, S.; Ziegenhagen, B.; Huard, F.; Ullrich, K. K.; Postolache, D.; Vendramin, G. G.; Fady, B.: Evidence of divergent selection for drought and cold tolerance at landscape and local scales in Abies alba Mill. in the French Mediterranean Alps. Molecular Ecology 25 (3), S. 776 - 794 (2016)

Heer, K.; Ullrich, K. K.; Liepelt, S.; Rensing, S. A.; Zhou, J.; Ziegenhagen, B.; Opgenoorth, L.: Detection of SNPs based on transcriptome sequencing in Norway spruce (Picea abies (L.) Karst). Conservation Genetics Resources 8 (2), S. 105 - 107 (2016)

Moog, D.; Rensing, S. A.; Archibald, J. M.; Maier, U. G.; Ullrich, K. K.: Localization and evolution of putative triose phosphate translocators in the Diatom Phaeodactylum tricornutum. Genome Biology and Evolution 7 (11), S. 2955 - 2969 (2015)