Publikationen

Zeitschriftenartikel (76)

  1. 1.
    Zeitschriftenartikel
    Suwandi, A.; Galeev, A.; Riedel, R.; Sharma, S.; Seeger, K.; Sterzenbach, T.; García Pastor, L.; Boyle, E. C.; Gal-Mor, O.; Hensel, M. et al.; Casadesús, J.; Baines, J. F.; Grassl, G. A.: Std fimbriae-fucose interaction increases Salmonella-induced intestinal inflammation and prolongs colonization. PLoS Pathogens 15 (7), e1007915 (2019)
  2. 2.
    Zeitschriftenartikel
    Lagkouvardos, I.; Lesker, T. R.; Hitch, T. C. A.; Gálvez, E. J. C.; Smit, N.; Neuhaus, K.; Wang, J.; Baines, J. F.; Abt, B.; Stecher, B. et al.; Overmann, J.; Strowig, T.; Clavel, T.: Sequence and cultivation study of Muribaculaceae reveals novel species, host preference, and functional potential of this yet undescribed family. Microbiome 7 (28), S. 1 - 15 (2019)
  3. 3.
    Zeitschriftenartikel
    Herp, S.; Brugiroux, S.; Garzetti, D.; Ring, D.; Jochum, L.M.; Beutler, M.; Eberl, C.; Hussain, S.; Walter, S.; Gerlach, R.G. et al.; Ruscheweyh, H.J.; Huson, D.; Sellin, M.E.; Slack, E.; Hanson, B.; Loy, A.; Baines, J. F.; Rausch, P.; Basic, M.; Bleich, A.; Berry, D.; Stecher, B.: Mucispirillum schaedleri antagonizes salmonella virulence to protect mice against Colitis. Cell Host & Microbe 25 (5), S. 681 - 694.e8 (2019)
  4. 4.
    Zeitschriftenartikel
    Langan, E.A.; Künstner, A.; Miodovnik, M.; Zillikens, D.; Thaçi, D.; Baines, J. F.; Ibrahim, S.M.; Solbach, W.; Knobloch, J.K.: Combined culture and metagenomic analyses reveal significant shifts in the composition of the cutaneous microbiome in psoriasis. British Journal of Dermatology 0 (0) (2019)
  5. 5.
    Zeitschriftenartikel
    Seitz, J.; Belheouane, M.; Schulz, N.; Dempfle, A.; Baines, J. F.; Herpertz-Dahlmann, B.: The impact of starvation on the microbiome and gut-brain interaction in Anorexia Nervosa. Frontiers in Neuroendocrinology 10, 41 (2019)
  6. 6.
    Zeitschriftenartikel
    Stolzer, I.; Kaden-Volynets, V.; Ruder, B.; Letizia, M.; Bittel, M.; Rausch, P.; Basic, M.; Bleich, A.; Baines, J. F.; Neurath, M. F. et al.; Wirtz, S.; Weidinger, C.; Bischoff, S. C.; Becker, C.; Günther, C.: Environmental microbial factors determine the pattern of inflammatory lesions in a murine model of Crohn’s Disease–Like inflammation. Inflammatory Bowel Diseases 00 (00), izz142 (2019)
  7. 7.
    Zeitschriftenartikel
    Lin, X. B.; Wang, T.; Stothard, P.; Corander, J.; Wang, J.; Baines, J. F.; Knowles, S. C. L.; Baltrūnaitė, L.; Tasseva, G.; Schmaltz, R. et al.; Tollenaar, S.; Cody, L. A.; Grenier, T.; Wu, W.; Ramer-Tait, A. E.; Walter, J.: The evolution of ecological facilitation within mixed-species biofilms in the mouse gastrointestinal tract. The ISME Journal 12 (11) (2018)
  8. 8.
    Zeitschriftenartikel
    Hadizadeh, F.; Bonfiglio, F.; Belheouane, M.; Vallier, M.; Sauer, S.; Bang, C.; Bujanda, L.; Andreasson, A.; Agreus, L.; Engstrand, L. et al.; Talley, N. J.; Rafter, J.; Baines, J. F.; Walter, S.; Franke, A.; D'Amato, M.: Faecal microbiota composition associates with abdominal pain in the general population. Gut 67 (4), S. 778 - 779 (2018)
  9. 9.
    Zeitschriftenartikel
    Linnenbrink, M.; Teschke, M.; Montero, I.; Vallier, M.; Tautz, D.: Meta-populational demes constitute a reservoir for large MHC allele diversity in wild house mice (Mus musculus). Frontiers in Zoology 15, 15 (2018)
  10. 10.
    Zeitschriftenartikel
    Graspeuntner, S.; Waschina, S.; Künzel, S.; Twisselmann, N.; Rausch, T. K.; Cloppenborg-Schmidt, K.; Zimmermann, J.; Viemann, D.; Herting, E.; Göpel, W. et al.; Baines, J. F.; Kaleta, C.; Rupp, J.; Härtel, C.; Pagel, J.: Gut dysbiosis with Bacilli dominance and accumulation of fermentation products precedes late-onset sepsis in preterm infants. Clinical Infectious Diseases, ciy882 (2018)
  11. 11.
    Zeitschriftenartikel
    Graspeuntner, S.; Loeper, N.; Künzel, S.; Baines, J. F.; Rupp, J.: Selection of validated hypervariable regions is crucial in 16S-based microbiota studies of the female genital tract. Scientific Reports 8, 9678 (2018)
  12. 12.
    Zeitschriftenartikel
    Hirose, M.; Schilf, P.; Gupta, Y.; Zarse, K.; Künstner, A.; Fähnrich, A.; Busch, H.; Yin, J.; Wright, M. N.; Ziegler, A. et al.; Vallier, M.; Belheouane, M.; Baines, J. F.; Tautz, D.; Johann, K.; Oelkrug, R.; Mittag, J.; Lehnert, H.; Othman, A.; Jöhren, O.; Schwaninger, M.; Prehn, C.; Adamski, J.; Shima, K.; Rupp, J.; Häsler, R.; Fuellen, G.; Köhling, R.; Ristow, M.; Ibrahim, S. M.: Low-level mitochondrial heteroplasmy modulates DNA replication, glucose metabolism and lifespan in mice. Scientific Reports 8 (1), 5872 (2018)
  13. 13.
    Zeitschriftenartikel
    Maixner, F.; Turaev, D.; Cazenave-Gassiot, A.; Janko, M.; Krause-Kyora, B.; Hoopmann, M. R.; Kusebauch, U.; Sartain, M.; Guerriero, G.; O’Sullivan, N. et al.; Teasdale, M.; Cipollini, G.; Paladin, A.; Mattiangeli, V.; Samadelli, M.; Tecchiati, U.; Putzer, A.; Palazoglu, M.; Meissen, J.; Lösch, S.; Rausch, P.; Baines, J. F.; Kim, B. J.; An, H.-J.; Gostner, P.; Egarter-Vigl, E.; Malfertheiner, P.; Keller, A.; Stark, R. W.; Wenk, M.; Bishop, D.; Bradley, D. G.; Fiehn, O.; Engstrand, L.; Moritz, R. L.; Doble, P.; Franke, A.; Nebel, A.; Oeggl, K.; Rattei, T.; Grimm, R.; Zink, A.: The Iceman’s last meal consisted of fat, wild meat, and cereals. Current Biology 28, S. 1 - e9 (2018)
  14. 14.
    Zeitschriftenartikel
    Ruhlemann, M. C.; Degenhardta, F.; Thingholm, L. B.; Wang, J.; Skieceviciene, J.; Rausch, P.; Hov, J. R.; Lieb, W.; Karlsen, T. H.; Laudes, M. et al.; Baines, J. F.; Heinsen, F.-A.; Franke, A.: Application of the distance-based F test in an mGWAS investigating β diversity of intestinal microbiota identifies variants in SLC9A8 (NHE8) and 3 other loci. Gut Microbes 9 (1), S. 68 - 75 (2018)
  15. 15.
    Zeitschriftenartikel
    Pagel, R.; Bär, F.; Schröder, T.; Sünderhauf, A.; Künstner, A.; Ibrahim, S. M.; Autenrieth‖, S. E.; Kalies, K.; König, P.; Tsang, A. H. et al.; Bettenworth, D.; Divanovic, S.; Lehnert, H.; Fellermann, K.; Oster, H.; Derer, S.; Sina, C.: Circadian rhythm disruption impairs tissue homeostasis and exacerbates chronic inflammation in the intestine. The FASEB Journal 31 (11), S. 4707 - 4719 (2017)
  16. 16.
    Zeitschriftenartikel
    Sommer, F.; Rühlemann, M. C.; Bang, C.; Höppner, M.; Rehman, A.; Kaleta, C.; Schmitt-Kopplin, P.; Dempfle, A.; Weidinger, S.; Ellinghaus, E. et al.; Krauss-Etschmann, S.; Schmidt-Arras, D.; Aden, K.; Schulte, D.; Ellinghaus, D.; Schreiber, S.; Tholey, A.; Rupp, J.; Laudes, M.; Baines, J. F.; Rosenstiel, P.; Franke, A.: Microbiomarkers in inflammatory bowel diseases: Caveats come with caviar. Gut 66 (10), S. 1734 - 1738 (2017)
  17. 17.
    Zeitschriftenartikel
    Tronstad, R. R.; Kummen, M.; Holm, K.; von Volkmann, H. L.; Anmarkrud, J. A.; Høivik, M. L.; Moum, B.; Gilja, O. H.; Hausken, T.; Baines, J. F. et al.; Karlsen, T. H.; Fiskerstrand, T.; Hov, J. R.: Guanylate cyclase C activation shapes the intestinal microbiota in patients with familial diarrhea and increased susceptibility for Crohn's Disease. Inflammatory Bowel Diseases 23 (10), S. 1752 - 1761 (2017)
  18. 18.
    Zeitschriftenartikel
    Herpertz-Dahlmann, B.; Seitz, J.; Baines, J.: Food matters: how the microbiome and gut-brain interaction might impact the development and course of anorexia nervosa. European Child & Adolescent Psychiatry 26 (9), S. 1031 - 1041 (2017)
  19. 19.
    Zeitschriftenartikel
    Vallier, M.; Abou Chakra, M.; Hindersin, L.; Linnenbrink, M.; Traulsen, A.; Baines, J. F.: Evaluating the maintenance of disease-associated variation at the blood group-related gene B4galnt2 in house mice. BMC Evolutionary Biology 17 (2017)
  20. 20.
    Zeitschriftenartikel
    Claussen, J. C.; Skiecevičienė, J.; Wang, J.; Rausch, P.; Karlsen, T. H.; Lieb, W.; Baines, J. F.; Franke, A.; Hütt, M.-T.: Boolean analysis reveals systematic interactions among low-abundance species in the human gut microbiome. PLoS Computational Biology 13 (6), e1005361, S. 1 - 21 (2017)
 
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